中国农业大学档案与校史馆的综合类档案馆藏共7个全宗，即国立北京大学农学院全宗、国立清华大学农学院全宗、华北大学农学院全宗、中央农业管理干部学院全宗、北京农业大学全宗、北京农业工程大学全宗和中国农业大学全宗，包括了1922年之后学校的党政管理、教学科研、基建生产、外事工作、财务等工作中产生的工作计划、总结、会议材料、学生学籍材料、科研项目材料、基建图纸、财会凭证、帐表等，是我校教学、科研、管理工作顺利开展的重要查考依据，是进行历史研究、编史修志的珍贵资料。

　　国立北京大学农学院、国立清华大学农学院和华北大学农学院3个全宗的大部分档案已移交北京市档案馆，学校现存档案仅36卷、361件，内容主要为学生名册、毕业生纪念册、刊物等，所属年代为1922年-1949年。中央农业干部管理学院全宗有档案326卷、27件，所属年代为1980年-2000年。北京农业大学全宗有档案19794卷、19935件，所属年代为1949年-1995年。北京农业工程大学全宗有档案19446卷、6656件，所属年代为1952年-1995年。中国农业大学全宗现有档案57500卷，72200余件（统计数据截止2011年10月）。馆内所藏的较珍贵的档案有：毛泽东主席签署的孙晓邨出任北京农业大学校长的任命书、周恩来总理签署的沈其益为北京农业大学副校长的任命书、学校多次合校、搬迁的国务院批文及交接手续等。

　　我校于20世纪90年代初建立名人档案，开始收集和保管学校知名教授、学者及院士等在教学、科研和个人生活中形成的档案，并利用名人档案馆藏和编研成果先后举办了多次展览，对学生进行尊师、爱校、热爱农业的生动教育。

　　中国农业大学档案与校史馆的人事类档案馆藏现有教职工档案6175份（包括暂存遗留档案1128份）；学生档案约20000份，其中研究生档案7300份，本科生档案12700份。（统计数据截止2011年10月）